南京医科大学第三附属医院（常州二院）神经外科始建于1981年，是国内较早成立的神经外科专科之一。经过几代人的不懈努力与传承发展，科室现已成长为江苏省内综合实力雄厚、亚专科设置齐全的神经外科临床诊疗、教学与科研中心之一。科室现为江苏省临床重点专科、常州市重点专科，并与德国海德堡大学合作成立国际颅脑肿瘤中心，引进北京天坛医院颅底肿瘤专家吴震教授创新团队。作为国家高级卒中中心、欧美同学会医师协会神经外科手术技能培训中心、常州地区首家国家卫健委脑出血外科诊疗基地，科室同时承担南京医科大学博士、硕士研究生培养任务，并为全国全科医生规范化培训基地。
科室现设阳湖神经外科和延陵神经外科两个病区，共开放床位100余张，其中神经外科重症监护专业床位24张、过渡重症监护床位16张。现有在编人员122人，包括博士学位7人（含在读3人）、博导、硕导3人。科室长期开展颅底肿瘤、术中唤醒麻醉下脑肿瘤及脊柱肿瘤切除等高难度肿瘤手术；复杂脑血管疾病手术及缺血性脑血管疾病再通手术；面肌痉挛、三叉神经痛、慢性意识障碍、卒中后偏瘫、帕金森病、难治性癫痫、糖尿病周围神经病变等功能性疾病的外科治疗。逐步形成了“颅底及脑功能区肿瘤切除”，“复杂脑血管疾病复合治疗”，“神经功能性疾病外科治疗”及“多模态神经重症监护”四大专科特色。近三年来，科室年均专科门诊量超过8200人次，出院患者2300余人次，手术量超过1200台次，其中四级手术比例超过60%，在常州地区的临床、科研、教学与培训中具有重要影响力。
科室设有数智神经研究室，下设分子生物学实验室和颅脑解剖实验室，承担国家自然科学基金、省社会发展项目等各级科研课题近20项，累计科研经费逾1000万元；获江苏省医学会医学科技二等奖1项、江苏省卫健委医学新技术引进奖二等奖3项、常州市科技进步三等奖1项。每年发表SCI及《中华》系列论文十余篇，其中SCI论文最高影响因子达20分。
